许昌市交通运输局是市政府组成部门，为正处级。根据市交通运输局职能配置、内设机构和人员编制规定，内设办公室、法规科、规划科、财务科、人事科、建设管理科、运输管理科、安全监督科、交通战备工作科和机关党委，核定行政编制26名，局长1名、副局长3名，正科级领导职数11名（含总工程师1名），副科级领导职数4名。
许昌市交通运输局现有局属事业单位5个，分别是：市公路事业发展中心（干部人事由市委组织部直接管理）、市交通运输综合行政执法支队、市道路运输服务中心（原市港航海事中心并入市道路运输服务中心）、市农村公路发展服务中心（原市交通工程定额质量监督站并入市农村公路发展服务中心）、市城市公共交通服务中心。